劳拉替尼基于靶向NGS的聚合酶链反应

2020-09-17 作者: 康安途海外就医

  劳拉替尼基于靶向NGS的聚合酶链反应?为了确定对患者的耐药机制,我们获得了肝损伤的活检标本,该样品在患者接受劳拉替尼期间正在扩大,因此我们可以进行分子检测。 FISH显示ALK重排,没有ALK扩增的迹象。由于MET被克唑替尼抑制并且已被确定为对更具选择性的第二代ALK抑制剂的潜在耐药机制,我们进行了FISH以确定MET是否被扩增(即,肿瘤DNA中有多个MET拷贝)。

  没有观察到MET扩增。使用基于靶向NGS的聚合酶链反应(PCR)分析(称为Snapshot NGS),我们在ALK激酶结构域中鉴定了两个突变:C1156Y(先前在该患者的克唑替尼后活检中检测到)和L1198F。通过Snapshot NGS未检测到38个与癌症相关的基因(例如EGFR和KRAS)的其他突变。劳拉替尼基于靶向NGS的聚合酶链反应?劳拉替尼一个月多少钱

  ALK C1156Y是已知的克唑替尼抗性突变,而据报道,ALK L1198F在间变性甲状腺癌中是功能获得性突变,在核磷蛋白-ALK重排的细胞系中是与F1174V结合的布加替尼抗性突变。妇女的肿瘤中有22个C1156Y和L1198F突变以相似的频率出现(分别为29%和35%),表明这两个突变位于ALK融合基因的同一等位基因上。

  劳拉替尼基于靶向NGS的聚合酶链反应?为了证实这一点,我们从冷冻肿瘤标本中提取的互补DNA中扩增了EML4-ALK,将PCR产物亚克隆到pCR4-TOPO载体中,并对单个菌落进行了测序。这两个突变位于同一等位基因上。接下来,我们在治疗前,患者接受克唑替尼治疗后疾病复发后,以及患者接受氯雷替尼治疗后疾病复发后,对患者治疗前的肿瘤组织样品进行了全外显子测序。我们在耐氯雷替尼的样本中检测到双重突变(ALK C1156Y–L1198F),对耐克唑替尼的样本检测到单一ALK C1156Y突变。在治疗前肿瘤中也以低频检测到ALK C1156Y。携带ALK C1156Y的肿瘤细胞比例在预处理肿瘤中小于7%,在对克唑替尼耐药的肿瘤中约占50%,在对氯雷替尼耐药的肿瘤中约占100%。仅在耐氯雷替尼的标本中检测到ALK L1198F突变。

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