劳拉替尼在模拟预测极性和非极性环境中大环构象集合的能力

　　劳拉替尼在模拟预测极性和非极性环境中大环构象集合的能力？在本研究中，我们以lorlatinib为例，评估了REMD模拟预测极性和非极性环境中大环构象集合的能力。水溶液用于模拟体液，而氯仿则用于模拟细胞膜的疏水内部。使用氯仿是因为它的介电常数（ε= 4.8），接近于脂质双层的介电常数（ε= 3.0），50。

　　并且它是用于NMR光谱分析的最常见的非极性溶剂。我们的模拟表明，溶剂对lorlatinib的构象分布具有重要影响，这种构象分布是通过分子间相互作用而产生的。通过溶液NMR实验验证了仿真结果，表明REMD仿真能够预测lorlatinib在两种环境中的总体情况。劳拉替尼在模拟预测极性和非极性环境中大环构象集合的能力？

　　通过在不同温度下对相邻复制品进行定期交换尝试，REMD仿真有望比cMD有效探索更大的构象空间，而cMD可能仍处于局部极小值。使用REMD，在300至600 K的温度下分别在两种溶剂（即CHCl3和H2O / DMSO（6：4）混合物）中模拟了lorlatinib。使用H2O / DMSO混合物是由于lorlatinib的水溶性差。劳拉替尼在模拟预测极性和非极性环境中大环构象集合的能力？劳拉替尼一个月多少钱？

　　我们计算了一维自由能曲线作为重原子RMSD的函数，这揭示了两种溶剂中模拟的出色收敛性，如三个时间段的自由能曲线所示：80 ，90和100 ns。在水溶液中仅发现一个构象P1，而在CHCl3中预测存在两个构象（P1和P2）。 P1类似于与ALK络合的lorlatinib的晶体结构（PDB ID：4CLI； Pc，RMSD为0.27Å），P2的RMSD为1.2Å至Pc。这表明氯雷替尼在水溶液中采用的构象与其靶蛋白（ALK和ROS1）结合。