布加替尼与ALK的结合力介绍

2020-08-06 作者: 康安途医疗旅游

  布加替尼与ALK的结合力介绍:为了阐明布加替尼对WT和突变的ALK的结合亲和力,在6种抑制剂-ALK系统上进行了MD模拟,然后进行MM / GBSA计算。计算得出的布加替尼与WT,L1196M,G1269A,F1174L和R1275Q ALK的结合自由能分别为-41.36,-43.50 -44.47,-42.68和-39.31 kcal / mol,克唑替尼-ALK为-37.18 kcal / mol。摩尔尽管实验数据低于计算的结合自由能,但计算的结合自由能值始终遵循实验活动的顺序,除了G1269A突变体具有更高的计算结合自由能。相对于WT ALK复合物,布加替尼与G1269A,L1196M,F1174L和R1275Q突变的ALK的结合自由能分别改变了3.13、2.16、1.34和-2.03 kcal / mol。

  布加替尼与ALK的结合力介绍:该结果表明,布加替尼蛋白的结合亲和力在L1196M,G1269A和F1174L突变体中可能增强,而在R1275Q突变体中则减弱。还可以看出,布加替尼与所有突变体和WT ALK结构的结合表现出比crizotinib结合到WT ALK结构中更有效和稳定的相互作用,这表明布加替尼在抑制WT ALK和ALK组成性突变方面应该比crizotinib具有更大的活性。 (L1196M,G1269A,F1174L和R1275Q)。同时,布加替尼在ALK阳性神经母细胞瘤中也显示出强大的治疗潜力。

  根据结合自由能的能量项,范德华(ΔEvdW),静电(ΔEele)和非极性(ΔE非极性)溶剂化能量的成分对brigatinib和crizotinib的结合起着巨大的作用。在这三个术语中,范德华相互作用(G1269A为-59.02 kcal / mol,R1275Q为-53.49 kcal / mol,F1174L为-58.01 kcal / mol,L1196M为-57.99 kcal / mol)是其中的主要驱动力。稳定四个突变系统的结合亲和力。静电贡献(G1269A为-19.49 kcal / mol,R1275Q为-18.95 kcal / mol,F1174L为-12.86 kcal / mol,L1196M为-15.73 kcal / mol)几乎是范德华贡献的三分之一。

  较强的和不利的极性溶剂化相互作用(∆GGB)抵消了完全有利的相互作用,产生不利的极性贡献(∆Gpolar)。范德华贡献(ΔEvdW)和非极性溶剂化贡献(ΔGSA)的总和是有利和重要的非极性贡献(ΔEnonpolar),它们比不利的极性贡献(ΔE极性)在四个突变的复合物中,表明活性口袋的疏水氨基酸残基在蛋白质与药物的结合过程中起着至关重要的作用。那布加替尼多少钱一盒,微信扫描下方二维码了解:

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