激酶区二次突变,约37%属于ALK继发性耐药突变。这其中又分为ALK激酶区突变(28%)和ALK基因拷贝数扩增 (9%)。ALK激酶区突变是最早明确的耐药机制,其突变种类包括:L1196M、L1152R、G1202R、G1269A、1151Tins、S1206Y、C1156Y、F1174C和D1203N。其中数量上微占优势的是L1196M。目前发现如患者发生耐药后,其ALK基因发生第二次突变的类型可会包括一种或多种突变形式。
ALK通路抑制后,肿瘤会出现其他的驱动基因及其相关信号通路异常来取代ALK基因,从而导致耐药的情况发生。最常见的基因是EGFR、KRAS等。
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