CAR-T作为肿瘤免疫治疗的方法之一，以其副作用小、治疗效果显著，被称为继手术、化疗、放疗后的第四大肿瘤治疗手段，其正逐渐成为未来肿瘤治疗的新方向。但是，它也有着不可避免的副作用及技术难题。（1）实体肿瘤效果较差。目前，治疗效果最成功的当数CD19-CAR-T，其在治疗急性白血病和非霍奇金淋巴瘤上有着神奇的疗效！但是，在实体肿瘤中，如肺癌、肝癌、胃癌等中的效果相差甚远。部分学者认为，这可能是由于实体肿瘤在长期缓慢的进展过程中，在体内构成一个肿瘤微环境，各种免疫细胞及细胞因子的浸润将实体肿瘤保护得十分严密，应此，CAR-T细胞很难达到治疗靶点，发挥治疗作用。如何进一步“装饰”T细胞，使其治疗作用更加强大将是未来CAR-T发展的重要方向。
（2）临床治疗的毒性问题。目前临床试验过程中，将CAR-T回输至患者体内后，常常发生一系列反应如发热、寒战、白细胞减少、肿瘤溶解综合征、细胞因子风暴、移植物抗宿主反应等，重则可能直接导致患者的死亡。部分学者认为，这可能是由于患者自身的肿瘤负荷过重或者发生再次免疫反应所致，那么，如何提高CAR-T的安全性，降低CAR-T的毒性，使得重症肿瘤患者也能从此治疗中获益也是未来改进此项免疫治疗技术所要面临难题之一。
（3）治疗价格昂贵。CAR-T作为肿瘤免疫疗法，其重要的特点就是个体化，但是也就是这一独领风骚的亮点使得其治疗价格也十分昂贵。CAR-T细胞在整个设计、制备以及治疗过程中必须实现个体化、定制化，目前尚不能实现批量生产。如何将成本降低，在技术和产业化方面进行优化，普惠众生才是将这项抗肿瘤利器发挥作用的终极目标。
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